1946年5月，远东国际军事庭开庭。
被告名单中，并没有日本天皇裕仁的名字。
但是，关于其应否担负战争任的问题，一直争论不休。在一项新闻调查中，有超过二成的日本人认为裕仁应退位，4%的日本人认为应废除天皇制。
1946年，美国主导制订的日本新宪法公布。新宪法仅仅将日本天皇作为国家和国民的“象征”，强调主权在民。
至此，裕仁终于不再插手国务，有闲暇从事自己的专业——生物学研究。
裕仁五年级时，就曾为自己解剖过的青蛙取名“正一位蛙大明神”，并进行厚葬。
1914年，皇宫请生物学家服部广太郎来做“太傅”，教授裕仁自然史和物理。
裕仁从此开始了作为生物专家的学术生涯。
战后，裕仁每周一、四下午和周六一天都会在皇居内的生物学研究室度过。据称，他一生发现了22种新水螅纲虫、68种新海蛞蝓、27种新螃蟹，出版了8本关于水螅纲虫分类的著作。
裕仁最后的著作《皇居的植物》，于1989年11月去世后出版。
从他开始，生物学成了日本皇室的“家学”——他的儿子明仁是著名的鱼类学家，明仁的儿子秋筱宫文仁亲王则是研究家鸡起源的专家。